More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2538 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
278 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.96 
 
 
273 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.58 
 
 
278 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.14 
 
 
277 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.85 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.97 
 
 
301 aa  281  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.56 
 
 
281 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.72 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.62 
 
 
274 aa  251  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.13 
 
 
273 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.56 
 
 
274 aa  248  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.06 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.31 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.06 
 
 
277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.58 
 
 
293 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.02 
 
 
272 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.44 
 
 
276 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.04 
 
 
275 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.4 
 
 
275 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.39 
 
 
277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.57 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.2 
 
 
273 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.27 
 
 
273 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.08 
 
 
273 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.89 
 
 
273 aa  208  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.55 
 
 
269 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.95 
 
 
255 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.34 
 
 
277 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.52 
 
 
273 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.06 
 
 
271 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.06 
 
 
271 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.28 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.9 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.76 
 
 
280 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.83 
 
 
270 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.35 
 
 
260 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 
269 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.94 
 
 
270 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.72 
 
 
268 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.04 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.05 
 
 
274 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 
273 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
273 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.33 
 
 
275 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 
270 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.33 
 
 
275 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 
273 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
271 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  40.69 
 
 
262 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.08 
 
 
274 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 
264 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 
272 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.66 
 
 
273 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 
272 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.71 
 
 
289 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
278 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
272 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 
270 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
272 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
270 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
270 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.03 
 
 
272 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 
272 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
270 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
272 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
293 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  39.02 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
272 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.15 
 
 
272 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
272 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
270 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
270 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
270 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
270 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.08 
 
 
276 aa  152  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 
271 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
270 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 
284 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.96 
 
 
289 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 
275 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
270 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
270 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
270 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.13 
 
 
276 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 
271 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 
285 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
267 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.93 
 
 
289 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
282 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
267 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 
280 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.3 
 
 
273 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>