More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4850 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 277 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  83.09 
 
 		 281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  82.73 
 
 		 281 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  79.7 
 
 		 266 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  74.35 
 
 		 278 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.74 
 
 		 273 aa  363  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.86 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.14 
 
 		 278 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.85 
 
 		 274 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.39 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.25 
 
 		 277 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.33 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.87 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.29 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.47 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.6 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.3 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.3 
 
 		 275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.4 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.21 
 
 		 271 aa  225  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.3 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.2 
 
 		 277 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.58 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.56 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.96 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.83 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.92 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.33 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.33 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.64 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.24 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.37 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.94 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.13 
 
 		 285 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 		 275 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.49 
 
 		 275 aa  171  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.69 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.54 
 
 		 270 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.52 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.24 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.54 
 
 		 273 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.04 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.15 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.28 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  39.93 
 
 		 283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  39.56 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.55 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.31 
 
 		 279 aa  152  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 271 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.13 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.15 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.31 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.31 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.46 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.46 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  38.22 
 
 		 262 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.38 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>