More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4472 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
268 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.12 
 
 
269 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 
274 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 
273 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 
276 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
286 aa  158  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
301 aa  158  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
281 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
276 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 
273 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 
289 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.86 
 
 
277 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 
277 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.49 
 
 
277 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
271 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
271 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
285 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
281 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 
275 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.42 
 
 
278 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.28 
 
 
272 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
271 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.48 
 
 
273 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.2 
 
 
273 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
272 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.93 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.13 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.78 
 
 
280 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 
289 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
275 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
279 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 
262 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.32 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.53 
 
 
269 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.86 
 
 
282 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.08 
 
 
282 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.93 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
274 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
273 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.57 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 
273 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.2 
 
 
293 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 
277 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
271 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 
272 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.89 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.38 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 
300 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 
271 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
272 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.11 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.93 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.84 
 
 
257 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.99 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.17 
 
 
271 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.94 
 
 
271 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.45 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2668  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.82 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.2 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.24 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.46 
 
 
272 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 
270 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.93 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.13 
 
 
273 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
285 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
273 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
288 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.27 
 
 
288 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
274 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.02 
 
 
270 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
274 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.51 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.22 
 
 
270 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.63 
 
 
274 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 
276 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.48 
 
 
275 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>