More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2684 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  87.59 
 
 		 274 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  86.5 
 
 		 289 aa  450  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.61 
 
 		 273 aa  358  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.63 
 
 		 278 aa  357  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.48 
 
 		 271 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.08 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.22 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.71 
 
 		 270 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.71 
 
 		 270 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.83 
 
 		 270 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.45 
 
 		 270 aa  308  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.83 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.83 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.07 
 
 		 270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.07 
 
 		 270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.07 
 
 		 270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.07 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.07 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.07 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.07 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.89 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.52 
 
 		 271 aa  288  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.44 
 
 		 270 aa  268  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.55 
 
 		 279 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.55 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.81 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.7 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.55 
 
 		 271 aa  248  8e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.03 
 
 		 271 aa  248  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.32 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.03 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.14 
 
 		 282 aa  244  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.55 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.73 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.6 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.63 
 
 		 279 aa  231  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.72 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.18 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.52 
 
 		 288 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.63 
 
 		 273 aa  218  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.52 
 
 		 288 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.62 
 
 		 275 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.26 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.65 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.29 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.45 
 
 		 277 aa  209  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.35 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.59 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.96 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  44.07 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.22 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.17 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.66 
 
 		 273 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.49 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.49 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.94 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.26 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.78 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 273 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.78 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.49 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.49 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.34 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  40.57 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.19 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.44 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.32 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.22 
 
 		 272 aa  175  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  37 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>