More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4063 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
277 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  98.19 
 
 
277 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  93.5 
 
 
276 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.91 
 
 
277 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.79 
 
 
272 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.51 
 
 
277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.57 
 
 
278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.56 
 
 
273 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.56 
 
 
301 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.91 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.87 
 
 
281 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.58 
 
 
266 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.25 
 
 
277 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.25 
 
 
273 aa  248  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.74 
 
 
281 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.5 
 
 
274 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.45 
 
 
273 aa  231  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.06 
 
 
278 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.64 
 
 
275 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.17 
 
 
274 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.79 
 
 
275 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.92 
 
 
293 aa  215  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.46 
 
 
268 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.19 
 
 
271 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.91 
 
 
273 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.83 
 
 
269 aa  185  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.15 
 
 
273 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 
269 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.02 
 
 
280 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.39 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.19 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.69 
 
 
275 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.82 
 
 
273 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.32 
 
 
275 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.76 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 
272 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.41 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 
264 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 
273 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 
289 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
272 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
260 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
272 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
273 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
272 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 
273 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.31 
 
 
270 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
272 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
282 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.72 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
273 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 
272 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.86 
 
 
289 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
272 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.25 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.07 
 
 
282 aa  152  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.98 
 
 
268 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.61 
 
 
267 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
277 aa  152  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 
274 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  41 
 
 
272 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 
271 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  38.13 
 
 
283 aa  149  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 
264 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
273 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  38.25 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  37.74 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.67 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
293 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 
270 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.83 
 
 
274 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.83 
 
 
274 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
270 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.93 
 
 
271 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
281 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
284 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.64 
 
 
269 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.14 
 
 
286 aa  142  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.15 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.59 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
270 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
267 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
270 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1383  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
263 aa  140  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
270 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
271 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>