More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3963 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  84.13 
 
 
271 aa  460  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  84.13 
 
 
271 aa  460  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.7 
 
 
269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.81 
 
 
273 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.42 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.63 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.5 
 
 
274 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.94 
 
 
273 aa  205  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.72 
 
 
274 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
269 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.07 
 
 
273 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.64 
 
 
277 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.41 
 
 
275 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.2 
 
 
301 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.27 
 
 
285 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.67 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 
278 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
281 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.79 
 
 
281 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.27 
 
 
275 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.84 
 
 
273 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.02 
 
 
276 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.13 
 
 
266 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.88 
 
 
273 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.02 
 
 
277 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.29 
 
 
278 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 
277 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.13 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.53 
 
 
273 aa  172  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
273 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.73 
 
 
275 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.61 
 
 
273 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.72 
 
 
273 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.8 
 
 
276 aa  168  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
293 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
275 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.72 
 
 
280 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 
273 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 
279 aa  165  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.45 
 
 
275 aa  165  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.45 
 
 
275 aa  165  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.26 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.07 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  39.19 
 
 
283 aa  163  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
272 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
271 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 
272 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.55 
 
 
277 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
274 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 
272 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 
273 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.48 
 
 
280 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 
273 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.9 
 
 
286 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 
272 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
272 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 
273 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 
272 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
270 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 
270 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
272 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
272 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.33 
 
 
260 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.02 
 
 
272 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
271 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.68 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.76 
 
 
266 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
270 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
267 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.78 
 
 
273 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.09 
 
 
270 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
280 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 
264 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.8 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.96 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
272 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.06 
 
 
285 aa  153  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.69 
 
 
273 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.01 
 
 
273 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
267 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 
270 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.32 
 
 
276 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.92 
 
 
284 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
270 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
271 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
270 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
293 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.49 
 
 
274 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0013  putative pyrroline-5-carboxylate reductase  30.45 
 
 
269 aa  149  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.78311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
272 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 
272 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.62 
 
 
270 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
272 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>