More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4171 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 281 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  87.54 
 
 		 281 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  83.09 
 
 		 277 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  78.79 
 
 		 266 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.02 
 
 		 278 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.13 
 
 		 273 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  69.63 
 
 		 301 aa  358  6e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.72 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.58 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.87 
 
 		 277 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.41 
 
 		 273 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.74 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.58 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.6 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.73 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.55 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.41 
 
 		 275 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.81 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.47 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.67 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.09 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.4 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.26 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.4 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.3 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.47 
 
 		 255 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.47 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.35 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.84 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.84 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.37 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.72 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.79 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.6 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.89 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.05 
 
 		 270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.23 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.49 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.08 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.28 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.63 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  39.11 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 271 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.77 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.77 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 271 aa  152  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  45 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.67 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  45 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.46 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  37.72 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  37.78 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.78 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.2 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.47 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.17 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.67 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.83 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.35 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>