More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2249 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 274 aa  540  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  77.74 
 
 		 275 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  76.6 
 
 		 275 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.7 
 
 		 273 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.85 
 
 		 277 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.23 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.47 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.43 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.31 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.81 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.48 
 
 		 278 aa  248  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.58 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.15 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.01 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.5 
 
 		 277 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.13 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.49 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.51 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.16 
 
 		 271 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.16 
 
 		 271 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.6 
 
 		 273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.52 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.12 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.83 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.95 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.01 
 
 		 277 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.72 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.71 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.68 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.77 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.49 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.94 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.94 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 		 273 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.01 
 
 		 280 aa  178  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 		 289 aa  175  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  41.45 
 
 		 283 aa  171  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.19 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.67 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.37 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.52 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 		 274 aa  158  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.42 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.46 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.82 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  39.09 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.82 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.99 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.43 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 		 262 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>