More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1502 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
289 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  89.27 
 
 
289 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.54 
 
 
271 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.18 
 
 
271 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.29 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.28 
 
 
270 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.55 
 
 
278 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.64 
 
 
270 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.04 
 
 
279 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 
271 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.63 
 
 
273 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.28 
 
 
270 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.64 
 
 
270 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.1 
 
 
282 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 
271 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.45 
 
 
274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.28 
 
 
270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.28 
 
 
270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.28 
 
 
270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.13 
 
 
278 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.73 
 
 
270 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.73 
 
 
270 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.73 
 
 
270 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.73 
 
 
270 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.73 
 
 
270 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.73 
 
 
270 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.36 
 
 
270 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.73 
 
 
270 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.72 
 
 
274 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.2 
 
 
289 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.48 
 
 
280 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.18 
 
 
271 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.74 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.49 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.68 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.55 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.96 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.21 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.73 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.07 
 
 
288 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.65 
 
 
288 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.17 
 
 
272 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.17 
 
 
272 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.81 
 
 
272 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.1 
 
 
273 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.09 
 
 
273 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 
272 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.8 
 
 
293 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.43 
 
 
284 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.01 
 
 
273 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.81 
 
 
272 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.17 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.73 
 
 
269 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 
273 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.88 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.75 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.69 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.78 
 
 
274 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.01 
 
 
282 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.78 
 
 
274 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
278 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
273 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 
273 aa  188  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.57 
 
 
274 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.43 
 
 
282 aa  185  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.65 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.33 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.58 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.33 
 
 
273 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 
273 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 
277 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.65 
 
 
285 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 
273 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.39 
 
 
286 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
274 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.49 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
278 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 
273 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 
281 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
272 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 
277 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 
270 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  39.08 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
266 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.2 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.21 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 
273 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
273 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
270 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.72 
 
 
277 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.69 
 
 
273 aa  169  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 
273 aa  168  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>