More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0160 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 267 aa  530  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  88.39 
 
 		 267 aa  474  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  86.52 
 
 		 267 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.97 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.88 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.86 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 272 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 		 272 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 		 270 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 		 280 aa  191  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.34 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.86 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 		 270 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.64 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.53 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 272 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 		 271 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  40.73 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 		 273 aa  168  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12663  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.19 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.09 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.82 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.64 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>