More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3701 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
274 aa  531  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.51 
 
 
270 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.51 
 
 
270 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.39 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.78 
 
 
270 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.99 
 
 
270 aa  281  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.14 
 
 
270 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.99 
 
 
270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.99 
 
 
270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.99 
 
 
270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.99 
 
 
270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.99 
 
 
270 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.99 
 
 
270 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.99 
 
 
270 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.03 
 
 
270 aa  278  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.93 
 
 
271 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.84 
 
 
271 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.78 
 
 
270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.41 
 
 
270 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.41 
 
 
270 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.41 
 
 
271 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.82 
 
 
274 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.29 
 
 
289 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.33 
 
 
273 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.21 
 
 
289 aa  248  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.73 
 
 
289 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.45 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.73 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.72 
 
 
278 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.71 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.18 
 
 
275 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.86 
 
 
280 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.99 
 
 
273 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.62 
 
 
285 aa  225  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.62 
 
 
273 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.08 
 
 
288 aa  224  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.08 
 
 
288 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 
271 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.39 
 
 
279 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.3 
 
 
282 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.45 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.69 
 
 
273 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.67 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.65 
 
 
272 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.09 
 
 
276 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
272 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.69 
 
 
278 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.27 
 
 
275 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.01 
 
 
272 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.36 
 
 
274 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.09 
 
 
277 aa  207  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.93 
 
 
271 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  43.59 
 
 
278 aa  205  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.73 
 
 
277 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.64 
 
 
285 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.52 
 
 
286 aa  202  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 
272 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 
282 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.71 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.38 
 
 
277 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.49 
 
 
274 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.49 
 
 
272 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.84 
 
 
282 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.19 
 
 
280 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  42.24 
 
 
283 aa  193  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.98 
 
 
284 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.15 
 
 
293 aa  192  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.24 
 
 
275 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.24 
 
 
275 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 
275 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.63 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 
272 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
272 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 
272 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.35 
 
 
272 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
273 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
267 aa  175  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
272 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
272 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
272 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 
273 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.28 
 
 
267 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
267 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.76 
 
 
272 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
272 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
273 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.67 
 
 
273 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
267 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
273 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 
274 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.94 
 
 
272 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>