More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0774 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  78.39 
 
 		 273 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  75.46 
 
 		 273 aa  417  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  75.09 
 
 		 273 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.06 
 
 		 273 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.13 
 
 		 273 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.13 
 
 		 273 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.13 
 
 		 273 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.47 
 
 		 272 aa  359  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.9 
 
 		 272 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.17 
 
 		 272 aa  352  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.54 
 
 		 272 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.84 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.58 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.53 
 
 		 273 aa  295  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.65 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.45 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 272 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.45 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.08 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.35 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.35 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.35 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.35 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.99 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.21 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.35 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.98 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 		 272 aa  232  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1126  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000450771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.06 
 
 		 285 aa  214  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.18 
 
 		 275 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.94 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.26 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.04 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.86 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.86 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.93 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.74 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.15 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.3 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.54 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.27 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.27 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.27 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.37 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.37 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.43 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 		 282 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  38.77 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.32 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.35 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>