More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0129 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
280 aa  565  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  44.89 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.4 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  44 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.22 
 
 
273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.4 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.04 
 
 
272 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.28 
 
 
273 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.14 
 
 
282 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.99 
 
 
272 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.73 
 
 
275 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.04 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.16 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.33 
 
 
271 aa  199  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.82 
 
 
285 aa  199  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.71 
 
 
276 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.45 
 
 
273 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.48 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.4 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.66 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.4 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.4 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.52 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.49 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.52 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 
274 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 
282 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 
270 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.91 
 
 
274 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 
270 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 
270 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 
270 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
272 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.96 
 
 
274 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.48 
 
 
272 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
273 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.61 
 
 
271 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.18 
 
 
271 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.45 
 
 
279 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
273 aa  191  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.98 
 
 
270 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 
267 aa  191  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.66 
 
 
270 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
273 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.48 
 
 
275 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.56 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.38 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.72 
 
 
270 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.36 
 
 
273 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 
274 aa  188  7e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.36 
 
 
273 aa  188  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.59 
 
 
270 aa  188  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.72 
 
 
270 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.72 
 
 
270 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 
274 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.01 
 
 
272 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
273 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.6 
 
 
277 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.65 
 
 
272 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.19 
 
 
274 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 
272 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 
272 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
267 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.57 
 
 
274 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  39.19 
 
 
283 aa  185  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.57 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 
280 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.36 
 
 
272 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.27 
 
 
267 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.17 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.85 
 
 
272 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.69 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.55 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 
289 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.27 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.03 
 
 
271 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.49 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.57 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
272 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 
272 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.09 
 
 
275 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
270 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.91 
 
 
270 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.47 
 
 
273 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.44 
 
 
274 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.73 
 
 
272 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.6 
 
 
273 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.87 
 
 
271 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.57 
 
 
271 aa  176  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>