More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3746 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 273 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.3 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.51 
 
 		 280 aa  310  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.62 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.38 
 
 		 285 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.65 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.49 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.19 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.33 
 
 		 271 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.31 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.31 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.76 
 
 		 271 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.65 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.93 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.65 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.48 
 
 		 271 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.56 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.36 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.36 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.36 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.56 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.36 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.36 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.36 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.36 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.18 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.06 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.06 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.06 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.88 
 
 		 270 aa  245  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.75 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.13 
 
 		 274 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.63 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.63 
 
 		 273 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.57 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.38 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.52 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.56 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.76 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.96 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.89 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.36 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.36 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.93 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.82 
 
 		 282 aa  198  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.05 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.79 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  42.09 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.86 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.78 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.57 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 		 282 aa  182  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.36 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.33 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.64 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.27 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.18 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.82 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.82 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 		 274 aa  168  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.49 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.82 
 
 		 274 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.94 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.78 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.42 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.49 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.49 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.6 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>