More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5956 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.05 
 
 		 267 aa  397  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.08 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12663  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.96 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 		 273 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.28 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.63 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.96 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.63 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.26 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.76 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.13 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.56 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.94 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.85 
 
 		 274 aa  151  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.19 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.9 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.57 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 		 280 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.1 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.06 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.8 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 		 280 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.87 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.47 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.22 
 
 		 281 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.85 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.02 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.83 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.84 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.83 
 
 		 272 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.97 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.34 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.19 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.19 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.03 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 		 275 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.59 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>