More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12663 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12663  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
266 aa  549  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
267 aa  188  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
268 aa  188  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.09 
 
 
267 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
267 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
267 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
272 aa  158  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
266 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.19 
 
 
271 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.31 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
272 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 
271 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
280 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
271 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
270 aa  148  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.9 
 
 
274 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
285 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
270 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.06 
 
 
273 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
273 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 
289 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
270 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
272 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
273 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.34 
 
 
280 aa  141  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.98 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.81 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.7 
 
 
272 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.92 
 
 
271 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.5 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.14 
 
 
279 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.27 
 
 
282 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
255 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.57 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
277 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
272 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
262 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.6 
 
 
272 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.22 
 
 
282 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
270 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
272 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.2 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.83 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.25 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.96 
 
 
274 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
275 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.53 
 
 
285 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
277 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
270 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
270 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.59 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.5 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.82 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 
270 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
264 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.02 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.17 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.8 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.09 
 
 
273 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.74 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
274 aa  132  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
273 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.08 
 
 
280 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
281 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.81 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.7 
 
 
276 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
274 aa  132  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 
273 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
278 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.85 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.83 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  30.27 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.74 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.45 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.83 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.55 
 
 
275 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  34.3 
 
 
266 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>