More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03579 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  92.65 
 
 
272 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.9 
 
 
272 aa  421  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  72.43 
 
 
272 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.67 
 
 
273 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.3 
 
 
273 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.47 
 
 
273 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.84 
 
 
273 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.64 
 
 
273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.64 
 
 
273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.27 
 
 
273 aa  351  8e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.17 
 
 
272 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.12 
 
 
274 aa  321  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.88 
 
 
273 aa  318  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.15 
 
 
272 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.25 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.78 
 
 
272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.78 
 
 
272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.78 
 
 
272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.78 
 
 
272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.78 
 
 
272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.78 
 
 
272 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.41 
 
 
272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.35 
 
 
273 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.57 
 
 
272 aa  295  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.31 
 
 
272 aa  294  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.31 
 
 
272 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.84 
 
 
272 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.21 
 
 
272 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.37 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.68 
 
 
271 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.04 
 
 
273 aa  268  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1126  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.53 
 
 
272 aa  255  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000450771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.59 
 
 
285 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.32 
 
 
275 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.91 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.15 
 
 
274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 
273 aa  208  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.99 
 
 
282 aa  208  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 
275 aa  208  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.17 
 
 
274 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.17 
 
 
274 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
275 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 
276 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
272 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
272 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.93 
 
 
285 aa  201  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.54 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3016  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.6 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 
274 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
273 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 
271 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 
273 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 
274 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 
272 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  40.79 
 
 
283 aa  193  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 
274 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.94 
 
 
277 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
272 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
271 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
278 aa  188  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 
289 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
270 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.65 
 
 
280 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 
277 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.91 
 
 
278 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
270 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
270 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
270 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
270 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
270 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
270 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
270 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 
273 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
271 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 
270 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.96 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 
267 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 
270 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.15 
 
 
269 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
270 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
270 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 
267 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 
270 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
289 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.56 
 
 
286 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.8 
 
 
275 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.26 
 
 
271 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.8 
 
 
275 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>