More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0759 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
273 aa  554  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  76.19 
 
 
273 aa  431  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  76.19 
 
 
273 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  75.82 
 
 
273 aa  414  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  78.39 
 
 
272 aa  408  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  69.23 
 
 
273 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  69.6 
 
 
273 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  69.23 
 
 
273 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.03 
 
 
272 aa  374  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.13 
 
 
272 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.3 
 
 
272 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.9 
 
 
272 aa  348  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.57 
 
 
274 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.48 
 
 
273 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.85 
 
 
271 aa  292  3e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.67 
 
 
273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.65 
 
 
272 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.92 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.92 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.08 
 
 
272 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.35 
 
 
272 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.35 
 
 
272 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.35 
 
 
272 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.35 
 
 
272 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.89 
 
 
272 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.92 
 
 
271 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.62 
 
 
272 aa  248  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 
272 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.26 
 
 
273 aa  244  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.47 
 
 
272 aa  241  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.05 
 
 
272 aa  241  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 
272 aa  238  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1126  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 
272 aa  225  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000450771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.7 
 
 
277 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.91 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.28 
 
 
275 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.9 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
275 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 
272 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.15 
 
 
292 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.53 
 
 
276 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 
272 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.62 
 
 
274 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.96 
 
 
274 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 
284 aa  202  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.56 
 
 
293 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 
277 aa  202  5e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.49 
 
 
273 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
277 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.49 
 
 
273 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.49 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.49 
 
 
272 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 
272 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 
272 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.49 
 
 
285 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 
282 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
274 aa  191  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
274 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
270 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 
278 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
267 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.07 
 
 
274 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 
272 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
273 aa  188  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 
271 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.19 
 
 
272 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.7 
 
 
289 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  40.22 
 
 
283 aa  185  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 
289 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 
270 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.82 
 
 
278 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 
271 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 
289 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.88 
 
 
280 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
271 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.27 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.03 
 
 
282 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
267 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
270 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3016  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.46 
 
 
264 aa  178  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 
273 aa  178  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
267 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
270 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
270 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.78 
 
 
275 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
270 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.78 
 
 
275 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 
272 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
271 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 
278 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
285 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
271 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>