More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1616 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
314 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.43 
 
 
272 aa  258  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.23 
 
 
272 aa  252  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.86 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.28 
 
 
281 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
271 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 
267 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
267 aa  202  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.81 
 
 
270 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
266 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 
276 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.61 
 
 
257 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
270 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
272 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 
274 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.35 
 
 
271 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
276 aa  170  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
275 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.32 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.63 
 
 
273 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.18 
 
 
275 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.05 
 
 
276 aa  165  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.01 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 
282 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
269 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.01 
 
 
271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
273 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 
278 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.97 
 
 
281 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 
264 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
264 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
270 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 
282 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
266 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.94 
 
 
272 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
270 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.13 
 
 
285 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
272 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
267 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
275 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 
264 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  35.93 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
272 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
273 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.46 
 
 
271 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
263 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
274 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.14 
 
 
267 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
272 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.84 
 
 
271 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.43 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.34 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
264 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.96 
 
 
273 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
281 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 
264 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.29 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.56 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
277 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
272 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.34 
 
 
272 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.46 
 
 
272 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
271 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
272 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
271 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
279 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
272 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 
285 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
272 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
272 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.84 
 
 
272 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
270 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.85 
 
 
274 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
294 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
294 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
294 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.8 
 
 
285 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.7 
 
 
270 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.7 
 
 
270 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.7 
 
 
270 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>