More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3719 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 273 aa  563  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.73 
 
 		 273 aa  355  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.34 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.07 
 
 		 272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.97 
 
 		 272 aa  325  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.88 
 
 		 272 aa  318  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.51 
 
 		 273 aa  315  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.3 
 
 		 274 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.95 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.58 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.11 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.11 
 
 		 273 aa  298  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.38 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.48 
 
 		 273 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.11 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.65 
 
 		 272 aa  278  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.38 
 
 		 272 aa  278  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.01 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.01 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.38 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.92 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.28 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.28 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.28 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.28 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.92 
 
 		 272 aa  268  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.11 
 
 		 271 aa  268  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.01 
 
 		 271 aa  259  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.34 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1126  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.18 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000450771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.4 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 274 aa  215  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.07 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 272 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.33 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.83 
 
 		 275 aa  208  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.66 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 		 293 aa  204  9e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 272 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.01 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.48 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.88 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.52 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.59 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3016  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 		 264 aa  188  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.59 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.87 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 		 270 aa  175  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.04 
 
 		 275 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.04 
 
 		 275 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 		 272 aa  175  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.2 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 270 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.16 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  36.23 
 
 		 283 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>