More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1680 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.74 
 
 
276 aa  328  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.62 
 
 
266 aa  311  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.47 
 
 
266 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  56.6 
 
 
266 aa  298  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.03 
 
 
266 aa  295  8e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.02 
 
 
266 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 
272 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 
269 aa  183  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 
273 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 
275 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.53 
 
 
282 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.24 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.24 
 
 
289 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
274 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
280 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 
274 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 
270 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 
274 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.54 
 
 
273 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.31 
 
 
270 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
279 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 
273 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
275 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
279 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
280 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
270 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.78 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 
271 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
285 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
270 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.07 
 
 
272 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 
293 aa  162  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 
279 aa  161  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.67 
 
 
274 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 
270 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
275 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  35 
 
 
272 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 
282 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  35 
 
 
272 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
271 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.78 
 
 
276 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 
278 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 
270 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 
267 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.46 
 
 
279 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.38 
 
 
272 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.62 
 
 
272 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 
272 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 
275 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 
272 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.62 
 
 
272 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 
272 aa  158  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
277 aa  158  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.7 
 
 
272 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 
271 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.62 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.78 
 
 
272 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
271 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
273 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 
276 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
281 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.04 
 
 
297 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 
264 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
273 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 
271 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
269 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
269 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
269 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 
274 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
269 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
269 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
269 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
272 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>