More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0351 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
280 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  68 
 
 
285 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.13 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.51 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.51 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.76 
 
 
279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.76 
 
 
279 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.76 
 
 
278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.39 
 
 
279 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.65 
 
 
279 aa  308  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.65 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.65 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.65 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.3 
 
 
281 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.56 
 
 
273 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.42 
 
 
281 aa  205  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.53 
 
 
264 aa  201  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.35 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.74 
 
 
270 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 
264 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 
270 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
272 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 
270 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
274 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 
271 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 
272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 
270 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
282 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.11 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
272 aa  188  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 
264 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 
267 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
270 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.56 
 
 
264 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
267 aa  185  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
274 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 
270 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 
268 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
269 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
274 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 
264 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
267 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
262 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
270 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 
278 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 
264 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
277 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 
272 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.37 
 
 
272 aa  175  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.42 
 
 
277 aa  175  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.15 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.13 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.66 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
267 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.29 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
276 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 
271 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 
268 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 
273 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 
294 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 
294 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 
294 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
274 aa  169  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 
270 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
275 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 
273 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 
269 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.55 
 
 
275 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
272 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 
279 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.22 
 
 
271 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
289 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0185  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.55 
 
 
267 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 
271 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.84 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.71 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1065  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.378355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.57 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5103  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.55 
 
 
267 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.63 
 
 
285 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.05 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
272 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0217  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.16 
 
 
267 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>