More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0660 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
271 aa  517  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.17 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.41 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.52 
 
 
270 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.47 
 
 
276 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.89 
 
 
264 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1003  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.45 
 
 
281 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.09 
 
 
276 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.67 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.79 
 
 
267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.69 
 
 
294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.69 
 
 
294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.69 
 
 
294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.85 
 
 
274 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.01 
 
 
267 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.33 
 
 
272 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.44 
 
 
267 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0075  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.08 
 
 
293 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0837  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.54 
 
 
306 aa  205  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.39 
 
 
270 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.79 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.91 
 
 
272 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.56 
 
 
267 aa  198  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.91 
 
 
267 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 
270 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  46.36 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.75 
 
 
272 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
273 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
272 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.15 
 
 
267 aa  191  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.83 
 
 
264 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.45 
 
 
271 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 
276 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.35 
 
 
297 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10509  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.99 
 
 
295 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.05 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.49 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.8 
 
 
270 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 
273 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
285 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
268 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 
275 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 
280 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 
280 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
272 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.65 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 
274 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
272 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
275 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.7 
 
 
270 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
276 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
276 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.44 
 
 
274 aa  175  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 
270 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.34 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.34 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
266 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
275 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 
270 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 
273 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.34 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
270 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.18 
 
 
276 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
271 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.54 
 
 
269 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 
279 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
272 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
272 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
272 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
272 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 
282 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.87 
 
 
277 aa  169  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
272 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
271 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 
280 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.6 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.86 
 
 
260 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
274 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
275 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3315  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.64 
 
 
545 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112509  normal  0.0752896 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.34 
 
 
278 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>