More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0610 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 267 aa  504  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.04 
 
 		 267 aa  309  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.85 
 
 		 264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.94 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.96 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.99 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.27 
 
 		 276 aa  270  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  56.11 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.09 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.47 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.64 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.56 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.7 
 
 		 268 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.93 
 
 		 267 aa  248  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3315  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.82 
 
 		 545 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112509  normal  0.0752896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.69 
 
 		 272 aa  240  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.85 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.46 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.44 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.44 
 
 		 270 aa  235  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.15 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.76 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.04 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.06 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.24 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.33 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.33 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.33 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.28 
 
 		 281 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.38 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1003  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.76 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.11 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.98 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.95 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.49 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  38.29 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0075  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.39 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.7 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 		 272 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.36 
 
 		 275 aa  181  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0399  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.36 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0837  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.85 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10509  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  41 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 279 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.53 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.35 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>