More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6140 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 297 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.86 
 
 		 267 aa  335  5.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.14 
 
 		 267 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  56 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.3 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.27 
 
 		 264 aa  285  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.88 
 
 		 270 aa  279  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  54.95 
 
 		 264 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.88 
 
 		 276 aa  275  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.55 
 
 		 270 aa  271  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.55 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.63 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.78 
 
 		 264 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.55 
 
 		 272 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.01 
 
 		 267 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.36 
 
 		 264 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.25 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3315  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.18 
 
 		 545 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112509  normal  0.0752896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.09 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.16 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.23 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.23 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.23 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0837  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.79 
 
 		 306 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0075  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.86 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.37 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1003  pyrroline-5-carboxylate reductase  48 
 
 		 281 aa  191  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10509  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.27 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.86 
 
 		 273 aa  185  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  42.34 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.36 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.03 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.39 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.18 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.35 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.94 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0399  pyrroline-5-carboxylate reductase  48 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.34 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.45 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  44 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.73 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.27 
 
 		 274 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.77 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.1 
 
 		 285 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.55 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.66 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.29 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.27 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.14 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.21 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.32 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.08 
 
 		 275 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.58 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.84 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.86 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.94 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.84 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.58 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.82 
 
 		 273 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.05 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.13 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.57 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.6 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.01 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  38.04 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.43 
 
 		 262 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.47 
 
 		 282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.99 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.92 
 
 		 266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.04 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.88 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.29 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.99 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.65 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.65 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.57 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.29 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.29 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.53 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.91 
 
 		 271 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.29 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.29 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.34 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.76 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.29 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.07 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>