More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0926 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
265 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3161  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.29 
 
 
269 aa  349  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00631355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.87 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.35 
 
 
276 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.83 
 
 
269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.1 
 
 
263 aa  217  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
271 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.78 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 
268 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
255 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
267 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.3 
 
 
262 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.64 
 
 
255 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.82 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
279 aa  151  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
273 aa  151  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.16 
 
 
264 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
280 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.09 
 
 
267 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
272 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.46 
 
 
272 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
272 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
272 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
276 aa  148  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
272 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.46 
 
 
272 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.93 
 
 
274 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
272 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
266 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.98 
 
 
266 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 
272 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.6 
 
 
272 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
276 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
270 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  34.81 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
270 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 
263 aa  143  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
281 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.44 
 
 
269 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
272 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.97 
 
 
272 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
271 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.7 
 
 
273 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.66 
 
 
276 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.72 
 
 
272 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.66 
 
 
276 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
271 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.25 
 
 
267 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
272 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
270 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.64 
 
 
270 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.13 
 
 
269 aa  142  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
270 aa  141  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.25 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
270 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.44 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  36.51 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.84 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.83 
 
 
272 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.83 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.45 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.09 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.09 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.72 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
264 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
270 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.2 
 
 
273 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
270 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
270 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
270 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
270 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
270 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>