More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0397 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 270 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.13 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.05 
 
 		 267 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.44 
 
 		 267 aa  261  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.57 
 
 		 273 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.63 
 
 		 272 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.63 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.17 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.38 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.49 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.65 
 
 		 274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.27 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.65 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.75 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.41 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.18 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.81 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.19 
 
 		 276 aa  235  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.17 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.73 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.53 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.88 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.86 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.97 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.67 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.46 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.46 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.27 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.35 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.35 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  43.18 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  43.96 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 		 271 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.66 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.66 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.55 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.49 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.7 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 274 aa  204  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 279 aa  204  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 		 265 aa  204  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.83 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.98 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.91 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.55 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 		 270 aa  198  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.11 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.36 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.9 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>