More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3151 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 265 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.61 
 
 		 272 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.47 
 
 		 272 aa  334  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.47 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.47 
 
 		 272 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.71 
 
 		 272 aa  329  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.71 
 
 		 272 aa  328  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.71 
 
 		 272 aa  328  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.71 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.33 
 
 		 272 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.71 
 
 		 272 aa  324  8.000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.21 
 
 		 276 aa  323  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.21 
 
 		 276 aa  323  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.71 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.04 
 
 		 260 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.65 
 
 		 260 aa  301  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.73 
 
 		 266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.34 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.27 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.89 
 
 		 269 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.89 
 
 		 269 aa  265  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.89 
 
 		 269 aa  265  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.89 
 
 		 269 aa  265  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  51.89 
 
 		 269 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.89 
 
 		 269 aa  265  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.89 
 
 		 269 aa  265  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.52 
 
 		 269 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.76 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.76 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.76 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.76 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.76 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.38 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.3 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.08 
 
 		 271 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.53 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.91 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 		 266 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 		 272 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  42.35 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2105  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.43 
 
 		 154 aa  204  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3154  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.76 
 
 		 154 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.369849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 274 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2991  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.77 
 
 		 143 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000344161 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  40.91 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 272 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 265 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0752  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.95 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.212702  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.61 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.9 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.1 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.25 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.98 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.96 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.86 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.53 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>