More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0968 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
271 aa  534  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.82 
 
 
275 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.3 
 
 
266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.3 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.49 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 
272 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 
272 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
265 aa  191  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 
272 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.19 
 
 
272 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
272 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
272 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.19 
 
 
272 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.56 
 
 
272 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.56 
 
 
272 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.98 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
267 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 
270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
269 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
269 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
269 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
269 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
269 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
270 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  40.07 
 
 
269 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
269 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 
273 aa  178  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 
272 aa  178  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 
269 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.44 
 
 
274 aa  175  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.36 
 
 
276 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.9 
 
 
260 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.9 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.78 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 
274 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
274 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
264 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 
267 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
274 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 
256 aa  168  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
272 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
272 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.94 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  38.89 
 
 
276 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.98 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.93 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  37.22 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0752  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.212702  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
256 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
277 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
272 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.64 
 
 
271 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 
270 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
266 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
272 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
275 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
281 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.09 
 
 
272 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
280 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
270 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.86 
 
 
257 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.34 
 
 
266 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
269 aa  152  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
279 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.93 
 
 
279 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
279 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
279 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
263 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
266 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
273 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
275 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
279 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
279 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
279 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  34.91 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.07 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>