More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1828 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.02 
 
 
256 aa  345  5e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.03 
 
 
263 aa  238  6.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.3 
 
 
266 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
266 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.93 
 
 
273 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
267 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
267 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.7 
 
 
270 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 
265 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.02 
 
 
270 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.87 
 
 
270 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.02 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 
271 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.26 
 
 
272 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
272 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.11 
 
 
272 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.11 
 
 
272 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.48 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.5 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
272 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
272 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.83 
 
 
269 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
272 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.92 
 
 
264 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.25 
 
 
270 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.44 
 
 
272 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
272 aa  141  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.25 
 
 
274 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.25 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.57 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
264 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.84 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
266 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
270 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  34.73 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
271 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
276 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
276 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
269 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.45 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0408643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.44 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.46 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  35.21 
 
 
289 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.44 
 
 
285 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.8 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
271 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.1 
 
 
260 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
272 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.94 
 
 
279 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.27 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.89 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
277 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.37 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.94 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.44 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
279 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  31.85 
 
 
264 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.53 
 
 
269 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.39 
 
 
267 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
272 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 
267 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
279 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
279 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.32 
 
 
273 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
262 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  31.91 
 
 
276 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>