More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0780 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.25 
 
 
260 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.15 
 
 
262 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.05 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.3 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
272 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.22 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.88 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.8 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.33 
 
 
270 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.01 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.92 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.4 
 
 
278 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.7 
 
 
268 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.69 
 
 
263 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.97 
 
 
264 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.92 
 
 
266 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.06 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1723  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000160405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.3 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.18 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0568  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
281 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000161588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.92 
 
 
270 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.07 
 
 
256 aa  116  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
264 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.42 
 
 
280 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
268 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.65 
 
 
276 aa  115  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.62 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.56 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.48 
 
 
267 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.45 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.74 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.86 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  30.8 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.25 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
270 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.23 
 
 
260 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0392  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.32 
 
 
270 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231442  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.12 
 
 
274 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.01 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.39 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1569  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000273602  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04581  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.11 
 
 
270 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.958879  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.74 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.63 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.87 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.09 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.52 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04471  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.24 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.48 
 
 
274 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.01 
 
 
272 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.06 
 
 
264 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.26 
 
 
289 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.95 
 
 
280 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.15 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0357  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.79 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.76 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2207  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.36 
 
 
261 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.76 
 
 
267 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.9 
 
 
276 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04161  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.81 
 
 
270 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.74 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.12 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.17 
 
 
282 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.74 
 
 
267 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.18 
 
 
260 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.31 
 
 
263 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.67 
 
 
261 aa  106  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0408643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.03 
 
 
272 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
271 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.7 
 
 
267 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.59 
 
 
267 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.96 
 
 
266 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.09 
 
 
272 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.63 
 
 
272 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.25 
 
 
275 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.97 
 
 
262 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
271 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1373  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.73 
 
 
256 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.2219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.2 
 
 
276 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.83 
 
 
276 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.32 
 
 
267 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.32 
 
 
314 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3392  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.87 
 
 
258 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.653988  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.68 
 
 
279 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0551  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.6 
 
 
261 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  27.59 
 
 
266 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 
271 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0958  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.17 
 
 
231 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.764783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>