More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1755 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.18 
 
 		 271 aa  318  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.62 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.94 
 
 		 272 aa  268  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.19 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.23 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.23 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.5 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.5 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.5 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.5 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.5 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.12 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.12 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.5 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.12 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.12 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  48.12 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.12 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.12 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.74 
 
 		 269 aa  261  8e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.59 
 
 		 272 aa  258  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 		 272 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.83 
 
 		 272 aa  255  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.83 
 
 		 272 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.3 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.69 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.67 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.83 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.45 
 
 		 272 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.45 
 
 		 272 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.08 
 
 		 272 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.21 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.82 
 
 		 266 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.91 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.49 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 		 263 aa  215  8e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 		 274 aa  212  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 		 279 aa  205  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.85 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.85 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3154  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.28 
 
 		 154 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.369849 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.19 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.54 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2105  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.29 
 
 		 154 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0752  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.94 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.212702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 		 275 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 		 271 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  37.36 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 		 267 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  36.49 
 
 		 276 aa  175  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.45 
 
 		 281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.32 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.2 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.57 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.02 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.98 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.03 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>