More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2668 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2668  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.83 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.33 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.33 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.28 
 
 
273 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.35 
 
 
272 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.36 
 
 
272 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.27 
 
 
273 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.45 
 
 
273 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.55 
 
 
268 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.67 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.58 
 
 
277 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.78 
 
 
274 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 
271 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 
271 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.36 
 
 
272 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.27 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
270 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
270 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
270 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
270 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.57 
 
 
272 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.51 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.51 
 
 
274 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 
274 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.86 
 
 
272 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
272 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 
282 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 
280 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 
270 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 
275 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
271 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  35.29 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.59 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
267 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 
270 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 
270 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.56 
 
 
278 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 
270 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 
275 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.88 
 
 
271 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.81 
 
 
275 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  34.31 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.77 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.92 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.45 
 
 
268 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  38.21 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.76 
 
 
277 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 
285 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 
276 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.93 
 
 
276 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.6 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.04 
 
 
273 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.62 
 
 
280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.84 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.29 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.5 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.1 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.45 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.78 
 
 
274 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.86 
 
 
273 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.7 
 
 
277 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 
271 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.31 
 
 
286 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.3 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.6 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.42 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.63 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.69 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 
289 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.16 
 
 
277 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
271 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.1 
 
 
277 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.36 
 
 
265 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>