More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1440 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
267 aa  533  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3161  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.31 
 
 
269 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00631355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.87 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.88 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.67 
 
 
276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.7 
 
 
263 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
266 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.84 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.84 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
272 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
272 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.98 
 
 
271 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.27 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
260 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.88 
 
 
266 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
272 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.5 
 
 
266 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
272 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
272 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 
267 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
272 aa  158  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
262 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.62 
 
 
265 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 
268 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.27 
 
 
266 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.24 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.92 
 
 
279 aa  152  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.35 
 
 
276 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.35 
 
 
276 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.46 
 
 
270 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  35.47 
 
 
269 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  35 
 
 
267 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
272 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
269 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
269 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
266 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
269 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
269 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
269 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
269 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
269 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.1 
 
 
276 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.79 
 
 
282 aa  148  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
269 aa  148  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.6 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  36.18 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.3 
 
 
260 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.97 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.98 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.2 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.81 
 
 
263 aa  145  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
272 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.91 
 
 
260 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0344  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.77 
 
 
257 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.78 
 
 
267 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.69 
 
 
264 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
264 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.1 
 
 
273 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
266 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
270 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.81 
 
 
289 aa  142  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.05 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.03 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.37 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.54 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.02 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.09 
 
 
266 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
272 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.11 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.81 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  35.69 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.75 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.35 
 
 
274 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.66 
 
 
270 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.34 
 
 
279 aa  138  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.02 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
255 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
280 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.35 
 
 
274 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
272 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.77 
 
 
297 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
267 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  35 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>