More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0344 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0344  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
257 aa  512  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.38 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.77 
 
 
267 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.94 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.22 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
271 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
274 aa  138  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.41 
 
 
267 aa  135  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.381317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.36 
 
 
271 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.16 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 
272 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
272 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
270 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.3 
 
 
270 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.54 
 
 
257 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.37 
 
 
265 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
269 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
269 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
269 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
269 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  31.15 
 
 
269 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
269 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.41 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.81 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.81 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.35 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.64 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.98 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 
269 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.91 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.69 
 
 
267 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
272 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
272 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
276 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
276 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.63 
 
 
266 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  32.56 
 
 
289 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.07 
 
 
263 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
272 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.96 
 
 
269 aa  122  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 
266 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.24 
 
 
266 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.06 
 
 
273 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.53 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.51 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.42 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.51 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 
270 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.64 
 
 
272 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.06 
 
 
273 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.76 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
272 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.1 
 
 
294 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.07 
 
 
270 aa  118  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.1 
 
 
294 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.1 
 
 
294 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
272 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
272 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
272 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.5 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.29 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.34 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.34 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.36 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.35 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3161  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.37 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00631355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0399  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.1 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.39 
 
 
272 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.8 
 
 
265 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.48 
 
 
280 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.27 
 
 
272 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.66 
 
 
270 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.01 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.33 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.52 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.61 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.95 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>