More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0647 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.381317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.92 
 
 		 266 aa  338  4e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.08 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.33 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.63 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.9 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.51 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.24 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.62 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.63 
 
 		 276 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.62 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.81 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.62 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.83 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.07 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.02 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.5 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.36 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.02 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.02 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.63 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.62 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.63 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.22 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.99 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.63 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  33.6 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.94 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.94 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.2 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  35.94 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  36.68 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0344  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.41 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.28 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.55 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.56 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.75 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.56 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.05 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.16 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.16 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.16 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.16 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.09 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.16 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.94 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.3 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.76 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.13 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.27 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.37 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.37 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.37 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.33 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.73 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.16 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.59 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.55 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.76 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.25 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  31.3 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.17 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.28 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0958  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.5 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.764783  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0752  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.212702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.86 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>