78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2437 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1036    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  37.91 
 
 		 581 aa  355  8.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  39.67 
 
 		 542 aa  347  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  38.22 
 
 		 531 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  41.08 
 
 		 539 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  38.18 
 
 		 491 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  38.95 
 
 		 529 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  34.68 
 
 		 563 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  37.92 
 
 		 550 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  37.75 
 
 		 572 aa  282  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  36.25 
 
 		 533 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  33.85 
 
 		 551 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  35.84 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  34.24 
 
 		 639 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  36.02 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  30.39 
 
 		 632 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  30.94 
 
 		 645 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  33.92 
 
 		 593 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  34.71 
 
 		 622 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  34.07 
 
 		 561 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  32.48 
 
 		 591 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 571 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  33.33 
 
 		 624 aa  249  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  30.32 
 
 		 658 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  34.6 
 
 		 606 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  31.79 
 
 		 604 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  33.33 
 
 		 600 aa  233  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  31.26 
 
 		 589 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  31.15 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  31.15 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  32.05 
 
 		 581 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  32.05 
 
 		 581 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  32.77 
 
 		 550 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  31.79 
 
 		 518 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  27.98 
 
 		 543 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  29.48 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  29.96 
 
 		 643 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  27.83 
 
 		 666 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  27.83 
 
 		 666 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  28.65 
 
 		 548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  32.35 
 
 		 641 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  26.67 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  28.16 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  27.74 
 
 		 510 aa  150  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  28.06 
 
 		 543 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  28.63 
 
 		 528 aa  143  8e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  26.75 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  28.57 
 
 		 629 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  27.86 
 
 		 561 aa  137  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  25.62 
 
 		 555 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  27.61 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  26.14 
 
 		 514 aa  133  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  28.12 
 
 		 568 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  26.94 
 
 		 531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  27.41 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  35 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  24.81 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  38.73 
 
 		 578 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  23.18 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  28.57 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  34.68 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  23.67 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  23.69 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  24.57 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  23.16 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  22.96 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  21.39 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  24.87 
 
 		 384 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  24.8 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25.21 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  35.05 
 
 		 261 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  22.89 
 
 		 426 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  22.2 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  22.71 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  35.38 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  35.38 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  20.72 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  27.08 
 
 		 485 aa  43.9  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>