203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3816 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  72.93 
 
 
183 aa  276  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  45.51 
 
 
178 aa  147  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  46.11 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  45.56 
 
 
181 aa  141  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.33 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.54 
 
 
192 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  44.26 
 
 
199 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.36 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.01 
 
 
178 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.56 
 
 
180 aa  121  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  41.67 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.58 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.52 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.52 
 
 
181 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  39.58 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.96 
 
 
181 aa  111  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.21 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.56 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.02 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 
181 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.02 
 
 
221 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.75 
 
 
180 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.79 
 
 
204 aa  104  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
204 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  36.82 
 
 
208 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
181 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.67 
 
 
188 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
188 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  35.14 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.16 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  30.89 
 
 
219 aa  97.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.08 
 
 
183 aa  97.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
217 aa  95.9  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  34.55 
 
 
198 aa  94.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
185 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
221 aa  92  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
219 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.81 
 
 
178 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  33.68 
 
 
199 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 
201 aa  91.3  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.59 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  32.14 
 
 
218 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  28.86 
 
 
228 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
197 aa  88.6  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.97 
 
 
178 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
188 aa  87.8  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
199 aa  87.8  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  35.62 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.08 
 
 
208 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.89 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.11 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0509  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.57 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  32.98 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.16 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.52 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  36.53 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.57 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  34.02 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  30.27 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.96 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
209 aa  79  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  30.89 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  33.68 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.72 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.94 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  30 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.89 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.79 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.85 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  29.45 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  30.85 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
197 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.72 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  31.01 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  32.56 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>