More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3644 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3644  ABC transporter related  100 
 
 
508 aa  1011    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0076  ABC transporter related  59.13 
 
 
507 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4122  ABC transporter related protein  47.36 
 
 
510 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.885223  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  46.95 
 
 
504 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  46.11 
 
 
510 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2215  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
501 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.89 
 
 
517 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.22 
 
 
508 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  44.6 
 
 
519 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.87 
 
 
495 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.77 
 
 
497 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  42.89 
 
 
509 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.48 
 
 
506 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  44.47 
 
 
521 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.65 
 
 
506 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  42.86 
 
 
513 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.42 
 
 
520 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.29 
 
 
500 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 
498 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  41.78 
 
 
512 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  40.33 
 
 
499 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
505 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  41.19 
 
 
499 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  41.78 
 
 
512 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 
508 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  42.89 
 
 
512 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.36 
 
 
494 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42.04 
 
 
507 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  42.65 
 
 
506 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
507 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.25 
 
 
514 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  42.74 
 
 
514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  42.74 
 
 
514 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  42.74 
 
 
514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42.04 
 
 
507 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.26 
 
 
497 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.33 
 
 
516 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.95 
 
 
503 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.57 
 
 
501 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  41.55 
 
 
501 aa  369  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2783  ABC transporter related  41.99 
 
 
513 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.86 
 
 
506 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2827  ABC transporter related  41.99 
 
 
513 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877357  normal  0.0187049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  40.59 
 
 
499 aa  365  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.87 
 
 
514 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  40.12 
 
 
497 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  43.28 
 
 
510 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  42.28 
 
 
500 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2810  ABC transporter related  41.78 
 
 
513 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276478  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  40.85 
 
 
499 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
499 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  41.5 
 
 
520 aa  363  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  43.24 
 
 
505 aa  363  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.58 
 
 
506 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  42.28 
 
 
511 aa  362  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.49 
 
 
515 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  41.5 
 
 
509 aa  362  8e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
499 aa  362  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.2 
 
 
501 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.7 
 
 
507 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.16 
 
 
861 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  41.56 
 
 
513 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
501 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 
511 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
499 aa  361  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  41.18 
 
 
513 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  42.68 
 
 
500 aa  360  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  39.8 
 
 
502 aa  359  6e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  41.87 
 
 
495 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  42.6 
 
 
492 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  41.05 
 
 
513 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.86 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  39.39 
 
 
507 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  42.59 
 
 
522 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  41.46 
 
 
511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.59 
 
 
512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  42.28 
 
 
506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  41.32 
 
 
517 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.2 
 
 
492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 
506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  42.63 
 
 
517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  43 
 
 
492 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  42.07 
 
 
528 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.8 
 
 
524 aa  356  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  42.27 
 
 
502 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  39.75 
 
 
501 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
505 aa  355  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
504 aa  355  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 
511 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  40.2 
 
 
506 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 
497 aa  354  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
517 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2301  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
517 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 
506 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  42.8 
 
 
503 aa  354  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  40.2 
 
 
511 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
506 aa  353  4e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  41.65 
 
 
495 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  38.23 
 
 
498 aa  353  5e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  41.99 
 
 
506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>