More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1863 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
333 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
335 aa  252  7e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
323 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
295 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
306 aa  229  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
330 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
330 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.19 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.42 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  32.82 
 
 
299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
295 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
298 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3658  glucose transport system permease protein  31.74 
 
 
372 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
309 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  32.34 
 
 
357 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
312 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968646  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
312 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
317 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
317 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
319 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
319 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
298 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
292 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
317 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
302 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
312 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
288 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
317 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
309 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  33.44 
 
 
295 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  32.34 
 
 
312 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  32.34 
 
 
312 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  32.34 
 
 
312 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  32.34 
 
 
312 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  32.34 
 
 
312 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
292 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  32.34 
 
 
312 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
302 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26620  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.88 
 
 
300 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
318 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.63 
 
 
312 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
314 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
292 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
312 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
312 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
298 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2082  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.44 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.785308  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.78 
 
 
349 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
292 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
302 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
349 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  32.67 
 
 
302 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  31.56 
 
 
310 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
302 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  31.64 
 
 
310 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
302 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
293 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
302 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
302 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.67 
 
 
302 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
298 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.473055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
305 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0514652  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5738  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.85 
 
 
302 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
301 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485351  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
301 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499107  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
309 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
313 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
294 aa  135  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.39 
 
 
300 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.255158 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748515 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
314 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  hitchhiker  0.000205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9199  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.54 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  28.61 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
302 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0276286  normal  0.845621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
317 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.156333  normal  0.563407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
307 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  32.98 
 
 
307 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3837  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
350 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344745  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 
299 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
325 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>