More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1395 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  100 
 
 
146 aa  305  2e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.19663e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
143 aa  188  3e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.18039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
149 aa  186  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  61.27 
 
 
148 aa  185  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.40761e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 
142 aa  185  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 
142 aa  185  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.18525e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
150 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
147 aa  184  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
150 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
150 aa  184  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 
150 aa  181  2e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
151 aa  182  2e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
151 aa  182  2e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  62.77 
 
 
143 aa  180  4e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.58972e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
144 aa  180  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.60952e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
145 aa  180  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.18025e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 
149 aa  179  9e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
150 aa  178  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  58.16 
 
 
147 aa  177  5e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
144 aa  177  5e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.46357e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
150 aa  176  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.52627e-09  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.18641e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.5141e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.92865e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.80495e-06  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.05135e-07  hitchhiker  3.559e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
151 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.11952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
142 aa  175  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.58843e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  53.9 
 
 
142 aa  176  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 
151 aa  175  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
143 aa  175  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.49881e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 
144 aa  174  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.32589e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 
149 aa  174  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.45483e-07  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 
170 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.28707e-09  hitchhiker  9.18521e-06 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 
144 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  6.97609e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  57.75 
 
 
147 aa  175  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.56575e-09  decreased coverage  1.94665e-06 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 
144 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.00743e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 
142 aa  174  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  58.39 
 
 
148 aa  174  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 
149 aa  174  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
143 aa  173  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.97035e-08  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
142 aa  173  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.31451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 
145 aa  173  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
143 aa  172  1e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  9.36521e-09  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
147 aa  172  1e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  57.04 
 
 
147 aa  172  1e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 
143 aa  172  1e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 
143 aa  172  2e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.78919e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
149 aa  171  2e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 
143 aa  171  3e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.56517e-13  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  53.79 
 
 
145 aa  171  3e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  1.19852e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 
145 aa  171  4e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.14694e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
147 aa  170  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.58182e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  55.4 
 
 
143 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
142 aa  170  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.22799e-07  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 
147 aa  170  6e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
142 aa  170  7e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  6.79553e-07  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  56.03 
 
 
147 aa  170  7e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
142 aa  169  8e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.72076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
145 aa  169  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.75046e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
145 aa  169  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.63354e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
145 aa  169  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
145 aa  169  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.45264e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
145 aa  169  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
145 aa  169  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.03793e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
145 aa  169  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.80183e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
144 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
149 aa  169  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  55 
 
 
143 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.82384e-07  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
145 aa  169  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.51399e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
149 aa  169  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.00491e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 
149 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  54.23 
 
 
149 aa  168  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 
143 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.23224e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  168  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.15233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
151 aa  168  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  167  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
142 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.33795e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
144 aa  168  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 
142 aa  167  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  51.77 
 
 
144 aa  167  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.57006e-06  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  168  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.38225e-05  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
142 aa  168  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.05698e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
147 aa  167  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
147 aa  167  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  167  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  1.51129e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  55.63 
 
 
146 aa  167  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  167  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.95186e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
145 aa  167  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.49627e-09  hitchhiker  1.137e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  7.56717e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  167  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  3.2614e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  167  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.36634e-07  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  2.44686e-07  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>