More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0619 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 345 aa  705    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  45.51 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  41.03 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  39.53 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  39.35 
 
 		 363 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  36.47 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  39.76 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  37.46 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  36.78 
 
 		 360 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  36.36 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  36.98 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  36.99 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 381 aa  242  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  41.59 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  37.98 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  36.9 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  36.89 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  37.61 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  38.91 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  36.07 
 
 		 360 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  38.07 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  36.47 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  35.53 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  36.28 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  37.25 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  38.07 
 
 		 373 aa  232  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  38.79 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  36.21 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  36.63 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  35.5 
 
 		 481 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  36.2 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  36.39 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  35.71 
 
 		 376 aa  228  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  34.91 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  36.69 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  34.91 
 
 		 426 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  37.57 
 
 		 421 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  36.86 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  36.86 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  36.47 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  36.47 
 
 		 449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  35.5 
 
 		 431 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  38.53 
 
 		 354 aa  225  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  37.72 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  34.93 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  37.25 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  36.18 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  35.24 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  35.71 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  37.07 
 
 		 430 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  35.96 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  35.01 
 
 		 435 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  36.26 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  34.33 
 
 		 429 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  35.71 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  35.42 
 
 		 431 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  35.59 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.73 
 
 		 414 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  36.61 
 
 		 417 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 410 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 430 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5822  DNA polymerase IV  33.23 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  34.86 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  35.52 
 
 		 429 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  35.91 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  34.65 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.98 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  35.88 
 
 		 453 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  35.07 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  35.48 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  34.29 
 
 		 408 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  34.52 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  35.71 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  34.67 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  35.17 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  35.42 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  34.63 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  35.51 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  35.71 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  34.62 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  38.24 
 
 		 357 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 412 aa  212  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  35.21 
 
 		 436 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  32.94 
 
 		 413 aa  212  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  36.01 
 
 		 423 aa  212  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  35.71 
 
 		 445 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.08 
 
 		 409 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  37.87 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 371 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  31.09 
 
 		 466 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  35.91 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>