80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6474 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 102 aa  203  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  64.08 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2185  hypothetical protein  66.22 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.141631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  43.56 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  41.35 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  39.78 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  37.74 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  37.74 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  38.14 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  32.67 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  43.9 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  44.44 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  35.87 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  35.92 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  35.92 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  36.96 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  34.07 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  43.43 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  46.75 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  39.76 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  29.17 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  38.83 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  28.12 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  32.08 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  38.61 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  33.7 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  37.11 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  30.53 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  41.57 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  33.7 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  27.59 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  35.63 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  35.63 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  33.98 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  41.25 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  40.85 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  31.87 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  29.35 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  34.34 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  32.26 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  29.79 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  29.35 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  29.55 
 
 		 109 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.13 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 101 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  32.1 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  28.41 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  36.14 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  45.16 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  33.8 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  30.61 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  40.54 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  31.33 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  32.91 
 
 		 87 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>