142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4508 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  59.43 
 
 		 703 aa  696    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 693 aa  1345    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  39.11 
 
 		 795 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.72 
 
 		 813 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  39.14 
 
 		 776 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.73 
 
 		 832 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.63 
 
 		 748 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.46 
 
 		 804 aa  357  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.27 
 
 		 746 aa  356  8.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  38.74 
 
 		 754 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  35.35 
 
 		 902 aa  353  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.35 
 
 		 733 aa  349  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.57 
 
 		 757 aa  348  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  38.49 
 
 		 734 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  35.58 
 
 		 759 aa  335  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40 
 
 		 766 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  36.71 
 
 		 735 aa  332  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  35.46 
 
 		 742 aa  332  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.6 
 
 		 724 aa  331  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.81 
 
 		 786 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  37.26 
 
 		 724 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  37.43 
 
 		 724 aa  328  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  37.43 
 
 		 724 aa  328  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  35.46 
 
 		 742 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.78 
 
 		 741 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.15 
 
 		 767 aa  324  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.95 
 
 		 732 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  34.57 
 
 		 758 aa  318  1e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  35.04 
 
 		 759 aa  316  9e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.29 
 
 		 788 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.36 
 
 		 758 aa  308  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  36.02 
 
 		 726 aa  304  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.12 
 
 		 747 aa  303  7.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  33.33 
 
 		 829 aa  287  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.27 
 
 		 691 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  37.6 
 
 		 799 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.43 
 
 		 685 aa  277  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  33.05 
 
 		 874 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  37.34 
 
 		 761 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  35.93 
 
 		 726 aa  271  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  37.16 
 
 		 706 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  38.29 
 
 		 750 aa  266  8.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  37.74 
 
 		 705 aa  264  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.78 
 
 		 672 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.55 
 
 		 705 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.05 
 
 		 659 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  35.58 
 
 		 666 aa  242  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.96 
 
 		 764 aa  237  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  32.49 
 
 		 742 aa  233  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  33.48 
 
 		 680 aa  232  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  39.88 
 
 		 765 aa  229  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  31.82 
 
 		 719 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  32.78 
 
 		 706 aa  223  9e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.42 
 
 		 670 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.8 
 
 		 710 aa  216  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  35.95 
 
 		 771 aa  213  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  32.68 
 
 		 692 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  33.33 
 
 		 727 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  29.59 
 
 		 715 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.94 
 
 		 695 aa  206  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.22 
 
 		 715 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  31.87 
 
 		 716 aa  203  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  30.09 
 
 		 1048 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  31.49 
 
 		 792 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.26 
 
 		 728 aa  193  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  31.56 
 
 		 717 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.64 
 
 		 732 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  35 
 
 		 684 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.19 
 
 		 861 aa  163  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.02 
 
 		 763 aa  161  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.66 
 
 		 763 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  43.91 
 
 		 679 aa  154  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  45.11 
 
 		 695 aa  153  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  35.5 
 
 		 710 aa  151  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.23 
 
 		 755 aa  142  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  41.18 
 
 		 717 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.15 
 
 		 645 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  35.86 
 
 		 706 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  28.44 
 
 		 706 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  31.84 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  32.21 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  32.21 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  32.21 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  32.21 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  32.21 
 
 		 691 aa  118  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  31.84 
 
 		 691 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  32.41 
 
 		 755 aa  117  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  31.84 
 
 		 689 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  32.21 
 
 		 689 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  31.84 
 
 		 691 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  38.86 
 
 		 712 aa  110  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  32.16 
 
 		 768 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  23.03 
 
 		 764 aa  109  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.98 
 
 		 753 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  35.26 
 
 		 768 aa  107  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  33.33 
 
 		 787 aa  107  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  38.69 
 
 		 785 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  32.11 
 
 		 702 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  32.56 
 
 		 760 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  31.8 
 
 		 702 aa  99  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>