More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4323 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  68.83 
 
 		 578 aa  714    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.72 
 
 		 572 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  64.44 
 
 		 597 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  100 
 
 		 547 aa  1050    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  49.34 
 
 		 547 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  47.35 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  50.93 
 
 		 563 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  48.59 
 
 		 557 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  48.04 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  51.16 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  50.09 
 
 		 536 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 565 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.18 
 
 		 583 aa  448  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  48.22 
 
 		 558 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.25 
 
 		 546 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.96 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  50.38 
 
 		 548 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  48.89 
 
 		 597 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  45.82 
 
 		 619 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  46 
 
 		 594 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  47.52 
 
 		 538 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 541 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  46.47 
 
 		 573 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  45.5 
 
 		 588 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  44.74 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  40.49 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  43.63 
 
 		 537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.32 
 
 		 619 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  43.23 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  48.35 
 
 		 551 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  44.32 
 
 		 542 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  45.83 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.79 
 
 		 643 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  41.33 
 
 		 615 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  41.87 
 
 		 527 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  42.65 
 
 		 613 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  41.45 
 
 		 611 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  45.68 
 
 		 565 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.7 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.6 
 
 		 536 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  42.11 
 
 		 571 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  50.38 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  40.71 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  46.48 
 
 		 547 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  41.9 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  43.04 
 
 		 537 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  42.31 
 
 		 573 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  43.36 
 
 		 544 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  41.7 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  43.66 
 
 		 542 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  47.76 
 
 		 542 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 536 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  42.29 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  41.98 
 
 		 562 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  41.74 
 
 		 571 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.07 
 
 		 536 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  42.21 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  46.64 
 
 		 550 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 		 544 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.81 
 
 		 548 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  45.27 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  42.33 
 
 		 555 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  42.86 
 
 		 556 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  43.8 
 
 		 548 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  43.01 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  42.86 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  43.48 
 
 		 606 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  42.39 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  45.69 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  41.64 
 
 		 535 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 		 534 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.86 
 
 		 584 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.36 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  45.08 
 
 		 542 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  39.49 
 
 		 611 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  43.36 
 
 		 600 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  42.41 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  41.68 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  39.71 
 
 		 611 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  43.07 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  43.38 
 
 		 543 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  42.41 
 
 		 565 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  42.8 
 
 		 542 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  39.55 
 
 		 522 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  43.57 
 
 		 543 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 		 633 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  43.5 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  47.66 
 
 		 545 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  40.11 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  46.55 
 
 		 545 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  40.36 
 
 		 627 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  40.57 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  43.64 
 
 		 592 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  42.17 
 
 		 579 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  40.56 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.99 
 
 		 611 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  43.83 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>