82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2537 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  788    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  35.73 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  32.56 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  32.56 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  32.56 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  32.56 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  32.56 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  35.14 
 
 		 393 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  32.31 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  35.14 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  35.14 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  35.14 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  32.56 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  35.14 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  37.02 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  37.74 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  35.77 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  36.04 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  36.04 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  35.77 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  35.77 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  35.77 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  35.77 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  35.77 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  36.04 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  35.06 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  35.06 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  34.81 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  36.9 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  35.77 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  33.6 
 
 		 399 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  32.07 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  35.37 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  34.59 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  34.59 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  34.59 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  34.59 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  34.32 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  34.32 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  34.78 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  27.3 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  29.81 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 405 aa  150  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 431 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  30.25 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 431 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 431 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  30.62 
 
 		 360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  28.91 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  27.51 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  33.18 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  26.53 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  25.49 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  38.64 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  21.17 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  20.05 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  35.29 
 
 		 370 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>