58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1877 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  100 
 
 		 388 aa  788    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  66.23 
 
 		 275 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  66.23 
 
 		 275 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  57.89 
 
 		 275 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  65.35 
 
 		 275 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  65.35 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  66.23 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  61.4 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  59.03 
 
 		 267 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  56.9 
 
 		 553 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  56.28 
 
 		 539 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  55.17 
 
 		 542 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  55.17 
 
 		 558 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  55.17 
 
 		 558 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  53.74 
 
 		 1346 aa  248  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  51.26 
 
 		 1503 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  48.52 
 
 		 1310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  39.92 
 
 		 285 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  36.12 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  35.79 
 
 		 657 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  37.04 
 
 		 538 aa  136  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  34.3 
 
 		 596 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  35.74 
 
 		 539 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  36.4 
 
 		 272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  33.86 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  33.98 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  32.8 
 
 		 614 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  33.86 
 
 		 617 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  30.71 
 
 		 516 aa  98.6  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  33.77 
 
 		 232 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  33.54 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  30.91 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  33.58 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.07 
 
 		 788 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  31.54 
 
 		 788 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  31.54 
 
 		 788 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.33 
 
 		 788 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.33 
 
 		 788 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.33 
 
 		 788 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.58 
 
 		 788 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.33 
 
 		 788 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  32.09 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 790 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.09 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  30.13 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  29.19 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  34.11 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  31.5 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  32.28 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  32.28 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  31.54 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  31.54 
 
 		 232 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  30 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28570  DNA-specific endonuclease I  27.37 
 
 		 237 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0779  Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier  34.41 
 
 		 760 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2493  DNA-specific endonuclease I  27.37 
 
 		 237 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  29.77 
 
 		 229 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0171  ribonuclease domain-containing protein  57.14 
 
 		 68 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>