More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4049 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 386 aa  755    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  98.19 
 
 		 386 aa  744    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  71.04 
 
 		 408 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  65.85 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  59.32 
 
 		 409 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  63.94 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  60 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  61.6 
 
 		 405 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  61.4 
 
 		 399 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  59.43 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  57.32 
 
 		 379 aa  355  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  54.08 
 
 		 401 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  55.1 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  55.22 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  51.17 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  51.25 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  53.25 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  51 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  48.96 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  51.86 
 
 		 320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  50.51 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  51.79 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  46.01 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  51.3 
 
 		 371 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  46.89 
 
 		 389 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  45.1 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  47.83 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  45.59 
 
 		 379 aa  272  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  46.37 
 
 		 377 aa  272  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  49.03 
 
 		 308 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  44.47 
 
 		 422 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  47.49 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  47.49 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  48.7 
 
 		 296 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  43.19 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 475 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  47.19 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  47.19 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  44.26 
 
 		 475 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  44.36 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  44.53 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  47.3 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  47.3 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  47.3 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  47.3 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  44.39 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  44.39 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  47.04 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  53.11 
 
 		 405 aa  255  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  48.32 
 
 		 433 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.01 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  42.69 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  45.84 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  42.64 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3125  DNA protecting protein DprA  44.92 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  46 
 
 		 361 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 370 aa  238  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  46 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.6 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  41.82 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.72 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  50.99 
 
 		 362 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  42.09 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40.53 
 
 		 371 aa  229  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  43.19 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  42.09 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  42.67 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  42.44 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.48 
 
 		 369 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.25 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  42.33 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  41.25 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  42.15 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  47.92 
 
 		 311 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  42.32 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  41.45 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  44.74 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  42.99 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  41.9 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  44.48 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  40.97 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.53 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  37.84 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  45.77 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  43 
 
 		 362 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  44.12 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.52 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  44.12 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  41.04 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  44.12 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  41.06 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  42.49 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  38.5 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>