117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0036 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0036  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 390 aa  723    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0606138  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2108  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 383 aa  242  9e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1162  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0310  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 366 aa  199  7.999999999999999e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  28.84 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  27.7 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  25.48 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  30.32 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  25 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  25 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  24.87 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  22.72 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  23.91 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  24.6 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  25.68 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  28.3 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  28.3 
 
 		 423 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  26.03 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  26.6 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  34.44 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  34.44 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  34.44 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  29.95 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  34.44 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 455 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  29.95 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  27.81 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 398 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  38.54 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  26.55 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1904  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1609  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  25.65 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  30.37 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  26.59 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>