28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0310 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0310  major facilitator transporter  100 
 
 		 366 aa  703    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2108  major facilitator superfamily MFS_1  48.27 
 
 		 383 aa  335  5.999999999999999e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1162  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 395 aa  298  9e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0036  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0606138  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  24.14 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 455 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  25 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  20.83 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  21.15 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  20.22 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 401 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 422 aa  42.7  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>